受到突如其来的怪兽袭击，地球上的人类几乎灭亡。为了人类最后的希望，由7名女性组成的TEAM·U守护着地球上最后的孩子。　　与此同时，因为听到呼唤而从其它宇宙前来的赛罗奥特曼、戴拿奥特曼和高斯奥特曼成功与TEAM·U会合。而侵略地球…

《AKB0048》是一部由开创“SF”ד偶像（歌）”ד变形机械”这一全新分野的河森正治监督总领全局，以近未来的宇宙为舞台的SF动画。地球毁灭之前曾经出现的一个传说中的偶像团体“AKB48”，沿袭了“AKB48”的名字并且继承她们灵魂的“…

在并不遥远的未来，人类文明高度发达，外星殖民不再是幻想。然而相对高度发达的科技，娱乐事业却受到前所未有的压制。艺能活动被认为具有蛊惑和腐蚀人心的恶劣影响而遭到当局禁止。好在渴望娱乐的种子仍在发芽，名为AKB0048的偶像团体志…